Comme dans de nombreux autres lacs des Pyrénées, le vairon y a été introduit, ce qui a eu de graves conséquences sur la biodiversité et le réseau trophique. Dans le Lac de Manhèra, une étude expérimentale d’éradication du vairon par des moyens mécaniques sera menée en vue de mettre en œuvre un protocole sécurisé d’utilisation de piscicides comme étape stratégique afin d’inverser les effets de l’invasion du vairon dans les lacs de montagne.
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