La pêche récréative y est interdite car, par le passé, on a tenté d’y établir une population de Salmonidés qui n’a pas prospéré. Néanmoins, le vairon utilisé autrefois comme appât pour la pêche des Salmonidés s’y est établi, et sa population est stable dans ce lac. L’estany de Naorte a été inclus comme espace d’intervention dans le précédent projet LIFE LIMNOPIRINEUS. Une réduction significative de la densité des populations de vairon y a été obtenue. Dans le cadre du projet actuel, l’objectif en est l’éradication totale.
