Este lago se sitúa en el SCI Aigüestortes, dentro de la Zona Periférica del Parque Nacional de Aigüestortes i Estany de Sant Maurici. Como en muchos otros lagos del Pirineo, se ha introducido el piscardo, lo que ha generado graves efectos sobre la biodiversidad y la estructura trófica. En el Lac de Manhera, se desarrollará un estudio experimental de erradicación del piscardo con medios químicos con el objetivo final de desarrollar un protocolo seguro para el uso de piscicidas como paso estratégico para revertir los efectos del piscardo en los lagos de montaña.
